Im Schaudepot des Museums werden die Sammlungen vorgestellt und in einen historischen Zusammenhang gestellt – mit den Orten, aus denen die Objekte stammen, den Synagogen oder den Sammlern wie etwa Max Berger oder Martin Schlaff. Das Atelier des Jüdischen Museums ist nicht nur eine Werkstatt, sondern auch Ausstellungsraum. Die Rituale in einem jüdischen Leben werden hier anhand von Museums-, aber auch Alltagsobjekten dargestellt. Im Audioguide führen zwei Jugendliche dazu einen Dialog und bringen jungen und erwachsenen BesucherInnen den jüdischen Alltag näher.
Im Atrium des Museums wird mit „Wien. Jüdisches Museum. 21. Jahrhundert“ eine Ausstellung gezeigt, die als erste Etappe auf dem Weg zur neuen Dauerausstellung konzipiert ist. Hier werden dem Publikum jene Themenbereiche präsentiert, die dem Museumsteam wichtig erscheinen. Die BesucherInnen werden eingeladen, ihre Fragen und Ideen mit dem Museumsteam zu diskutieren.